Direi che puoi procedere come preferisci .....
Mi pare d'aver capito che vorresti salvarle tutte ......
La cosa meno traumatica, sarebbe quella consigliata dal tuo amico ...... infatti , tagliando quelle di troppo, non vai a disturbare a livello radicale le prescelte, e la crescita continua.
Andando a disfare il pane per poterle reivasare singolarmente, sicuramente otterrai più piantine, ma devi mettere in conto, un periodo di ferma durante il quale le piantine debbono riprendersi. ( In questo caso, finchè non vedrai che ricominciano a crescere, è meglio tenerle all'ombra )
La prossima volta, utilizza i vasettini piccoli tipo quelli a 6 posti che si comprano con le piantine da orto. Metti 3-4 semini a vasetto e li metti fin da subito distanziati